rift: Окружённая среда

Нежно смотрит на микроба Аспирантка С. Петрова. Так же нежно в микроскоп На нее глядит микроб. ▫ Владимир Друк, ок.1983(?)

Когда в ближайшие годы кто-нибудь получит Нобелевскую премию за какой-то очередной прорыв в области двусторонних взаимовлияний микробиоты и хозяина, будет очень уместным если в начале Нобелевской лекции они процитируют стихотворение из эпиграфа. Потому что сорок лет назад идея интимной взаимности между человеком и микробами кроме vladimir_druk мало кому (если хоть кому-то) приходила в голову.

В последние несколько недель появились как минимум две очень интересные статьи на эту тему. В первой описывается тесная двусторонняя взаимосвязь между циркадными ритмами организма и суточной динамикой кишечной микробиоты. Хозяин влияет на микробиоту через режим питания, иммунные сигналы и обновление эпителия. В свою очередь, микробные метаболиты регулируют экспрессию циркадных генов в клетках хозяина.

Нарушение циркадных ритмов и ритмов микробиоты вызывает дисбиоз, воспаление, метаболические нарушения, иммунные реакции, и повышает риск ожирения, диабета 2 типа, воспалительных заболеваний кишечника и некоторых нейропсихиатрических заболеваний. Хронопитание может помочь восстановить согласованность между ритмами хозяина и микробиоты.

Вторая статья показывает, что генетика хозяина влияет на микробиоту не только напрямую, но и через горизонтальную передачу микробов между организмами. Простыми словами: наши кишечные бактерии в немалой степени отражают наши собственные сложные признаки, включая физиологические и поведенческие. И те, кому мы передаем эти наши бактерии (мойте руки перед едой!) могут стать похожими на нас!

То, что супруги, много лет прожившие вместе, становятся похожими друг на друга, эмпирически было известно очень давно. Ровно пять лет назад этот феномен был впервые исследован количественно на генетическом материале 81 тысячи семейных пар, используя 105 сложных признаков. Оказалось, что таки-да, становятся похожими, что означало существование горизонтальных косвенных генетических эффектов (indirect genetic effects или IGE), механизм которых оставался неясным. Нынешняя статья может помочь объяснить эффект "пропавшей наследуемости" (missing heritability) за счет значительного увеличения общей генетической вариации микробиомных признаков путем переноса от других людей.

Список важных практических выводов из этой статьи огромен. Новыми красками заиграла давняя идея о невыходе на одно поле с малосимпатичными людьми. Теперь у этой идеи есть полноценное научное обоснование. Стал полностью понятен всем известный призыв "не пей Иванушка, козлёночком станешь". Наконец, из более недавних литературных предсказаний, получило подтверждение "Возможно, чем-то иным ты станешь, когда, на выстрел подкравшись к ним, из них кого-то убьёшь и ранишь". Про аборигенов и Кука я уже молчу.

Источники:

1. Bautista J, Ojeda-Mosquera S, Altamirano-Colina A, Hidalgo-Tinoco C, Di Capua Delgado M, López-Cortés A. Bidirectional interactions between circadian rhythms and the gut microbiome. Appl Microbiol Biotechnol. 2025 Oct 10;109(1):218. PMID: 41071209; PMCID: PMC12513875.
https://doi.org/10.1007/s00253-025-13570-7

2. Tonnelé, H., Chen, D., Morillo, F. et al. Genetic architecture and mechanisms of host-microbiome interactions from a multi-cohort analysis of outbred laboratory rats. Nat Commun 16, 10126 (2025).
https://doi.org/10.1038/s41467-025-66105-z

Статья о горизонтальных косвенных генетических эффектах: Xia, C., Canela-Xandri, O., Rawlik, K. et al. Evidence of horizontal indirect genetic effects in humans. Nat Hum Behav 5, 399–406 (2021).
https://doi.org/10.1038/s41562-020-00991-9